瓦哈卡泥龟在野外，会猎食水中任何小于自己的动物，如鱼、虾、等，甚至是其它的龟，中间亦会食一些水生植物或掉下的水果。虽不常见，但猎食同类的情况曾有发现。人工饲养瓦哈卡泥龟可以喂吃新鲜的动物饵料，如杂鱼、小虾、螺蚌、蚯蚓、肉等等。
瓦哈卡泥龟对于食物的选择没有特别严格，通常来说更喜欢吃一些肉类的食物。另外瓦哈卡泥龟小龟在冬眠后，最易出现的状况有“冬眠后厌食症”、脱水、眼睛无法睁开、四肢无力、口腔发炎、呼吸系统出毛病、皮肤病、因缺乏维他命而虚弱、感冒等。根据各方面的研究，瓦哈卡泥龟冬眠结束后，逐日把温度及湿度，慢慢提高，接着让小瓦哈卡泥龟先进食水分、糖分较多的新鲜蔬果，如蕃茄、香蕉、提子等，之后投喂身型较小的昆虫或鱼，甚至可以把新鲜的肝脏喂饲。正常来说，该会在1至2周后恢复正常进食。
