巨头蛇颈龟腐皮是比较常见的病症。一般是水质不达标引起的。外用液体药物治疗：可用碘伏、聚维酮碘、双氧水、碘酊、紫药水。使用碘伏、聚维酮碘可稀释后浸泡治疗30分钟后干养。碘酊、双氧水、紫药水效果较好，但要防止误入眼部，造成巨头蛇颈龟的不适。一般轻微的腐皮，涂抹消毒，干养30分钟，连续3-4天，就可以自己慢慢愈合。
外用药膏类治疗：可用金霉素眼膏、红霉素眼膏、红霉素软膏、无极膏、硫软膏、阿昔洛韦乳膏、达克宁、百多邦等。从实用角度出发一般情况下无需用到达克宁、百多邦等太贵的药物。用法：1天涂抹1~2次后，大部分时间干养，半小时至一小时的时间泡水并完成喂食。干养的时候切忌不要时间过长，导致巨头蛇颈龟脱水。一般10天内可以治愈。
以上所列药膏，以硫软膏效果尤为突出，首选使用硫软膏治疗。
