狗狗对饲料有时候也会过敏，那是因为狗狗对特定蛋白质过敏，譬如牛肉和猪肉，这时候动物医师就会建议可以改用鸡肉和羊肉的饲料。可是久而久之，如果狗狗又开始对羊肉过敏的话，就要改用其他肉类饲料，甚至有些狗狗对所有肉类都过敏，最后只能吃素食的饲料。
限制疗法
狗狗食物过敏，动物医师就会让狗狗进行“限制疗法”让狗狗换吃其他种肉类的饲料，原本吃牛肉口味的，换吃羊肉。如果狗狗的过敏好了，就表示狗狗对牛肉的蛋白质会产生过敏。对蛋白质过敏有两种说法，一种是对蛋白质种类过敏，一种是对特定蛋白质大小过敏。
我们常会认为，长期暴露在某一种过敏原之下，渐渐地就不会对该过敏原敏感，这个观念其实是错的。狗狗因过敏换吃羊肉饲料，并不表示5年之后吃羊肉还是没问题，有可能在它体内产生过敏抗体之后才出现过敏反应。
食物的过敏是需要长时间接触后，才开始反应。过敏原会慢慢累积，这叫做慢性过敏。在国外，还有袋鼠肉的饲料，同样的饲料，美国或中国的狗狗吃都不会有问题，可是卖到澳洲就行不通。原因是澳洲的狗狗本来就一直吃袋鼠肉，过敏原早就已经累枳在澳洲狗狗体内，所以对袋鼠肉饲料的过敏情况就会比较严重。瑞典就给过敏的狗狗吃麋鹿肉饲料，这也是一种诊断与限制疗法。
水化蛋白质的疗法
另外，还有一种水化蛋白质的疗法。把蛋白质分子水化，切割成吸收之后不会引起过敏的大小，狗狗吃了就不会过敏。不过到目前为止还没有证据显示食物过敏会遗传，不像是吸入性过敏（空气和花粉），会随基因遗传到下一代。
